Ganska bred frågeställning, men jag ska göra mitt bästa.
Thailand:
Finns väldigt mycket att se; Kör Bangkok och Chiang Mai, sedan några öar längre söderut, antingen östkusten, västkusten, eller båda.
Malaysia:
Kuala Lumpur är alltid trevlig med byggnaderna och maten, sedan fina öar är Perhentians, Tioman, osv. Finns egentligen hur många som helst.
Singapore, finns massor här med, se
(FB) Singapore - En samlingstråd
Indonesien, finns extremt mycket. Jakarta är inte vacker, någon dag räcker för att se Monas och lite annat. Sedan skulle jag rekommendera något i stil med Komodo, Borneo, Lombok. Kan skriva lite mer ingående beroende på vad du är intresserad av.
Kambodja, Siem Reap (Angkor Wat) och Phnom Peng räcker typ...
Vietnam, kör hela landet, antingen Hanoi-HCMC eller tvärtom. Tar 2v ish.
Kan inte så mycket om Kina så överlåter det åt någon annan.
Filippinerna, på Palawan är extremt fint. Boracay är också trevligt men fler turister. Kolla Filippinernatråden.
Kan tyvärr inte så mycket om Japan heller.
Mellan länderna är oftast flyg lättast, om de inte gränsar då du kan ta buss eller liknande.
Dyka skulle jag gjort i Raja Ampat, men det kanske är lite avancerat. Langkawi, Gili-öarna eller liknande kanske är att rekommendera ist.