Om tiden spelar någon roll alls är det nog läge att välja Hiroshima. Trevlig stad för övrigt, med fantastiska berg ute i havet, som syns om ni åker ut till Miyajima. Det kan verkligen, verkligen rekommenderas! Bildsök.
Bra museum om atombomben i Horishima för övrigt.

Har inte varit i Nagasaki men har bara hört gott om den staden. Numera går väl Shinkansen nästan ända fram (iaf till Kagoshima) men det tar troligen mer än dubbelt så lång tid som till Hiroshima, även i bästa fall.