Okej, tänker på om det skulle bli något strul om man inte checkar in någon väska om det ingår i biljetten.

Incheckat bagage har varit frivilligt hos alla flygbolag jag flugit med.

Jo, att det ingår innebär inte att det måste användas.
Enda situationen jag kan tänka mig där det kan bli problem är om man flyger till/från Israel, som verkar ta säkerhetskontroll på allvar, och köper till en incheckad väska men inte lämnar in någon. Det borde kunna få någon säkerhetsansvarig att fundera lite mer än vanligt.
Med vanliga resmål/flygbolag är det bara att gå till säkerhetskontrollen. Ska man lämna Schengen kan det vara bra att kolla upp om passet ska registreras i förväg hos någon myndighet eller liknande, exempelvis Esta i USA.